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本研究以糖尿病GK大鼠为动物模型，综合运用16SrRNA基因扩增子测序、靶向代谢组学、转录组学等多组学技术，发现在改善大鼠代谢水平、调节肠道菌群结构、改变回肠基因表达谱以及缓解系统性和局部炎症等方面，小檗碱和葛根芩连汤发挥极其相似的作用，可作为该复方中的关键活性成分发挥调节肠道菌群、治疗糖尿病的功效。可能的作用机制是，葛根芩连汤和小檗碱可通过富集产丁酸细菌，调控肠道黏膜免疫和糖脂代谢等功能，从而减轻系统性和胰岛局部炎症水平，改善胰岛素抵抗。该研究为探究中药与肠道菌群的相互作用机制提供了很好的研究案例，并增进了对小檗碱这一有望用于治疗2型糖尿病的新药作用机制的理解。

中国科学院微生物研究所王军研究员、中国医院仝小林院士和赵林华研究员为共同通讯作者。中国科学院微生物研究所徐西占博士、中国医院高泽正博士为该论文的共同第一作者。该研究得到了中国科学院战略性先导科技专项、国家自然科学基金、中国科学院重点部署项目等多项资金的资助。